Tokio to miasto, w którym nie tylko komunikacja zewnętrzna jest bardzo mocno rozbudowana, ale ta cecha dotyczy także komunikacji wewnętrznej. Z tego też względu miasto wyposażone jest w system szynowy, w którym istnieje trzynaście linii metra. Linie te cechują się długością ponad trzysta kilometrów. Linie wewnętrzne należą do dwóch ogromnych korporacji, którymi są: Tokio metro oraz Toei. Oprócz tego, ze miasto wyposażone jest w bogatą sieć metra istnieją tu także dodatkowe niewielkie koleje automatyczne, które na razie działają na krótkich dystansach, lecz wciąż są ulepszane. Ruch wewnętrzny, jaki istnieje w mieście obsługiwany jest także przez kolej JR, która działa dzięki temu, że została wyposażona w linie średnicowe oraz obwodowe. Aby ruch mógł prężnie prosperować w tym ogromnym japońskim mieście wybudowano tu dużą obwodnicę, której trasa liczy około 100kilometrów. Znaczną rolę odgrywają obecnie także linie prywatne, które działają na ogół z intensywnością podobną do pracy metra. Wszystkie środki transportu, jakie działają w Tokio wyróżniają się wysokim standardem technicznym, co sprawia, ze dla podróżnych są bezpieczne i wygodne.